78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0677 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0677  NTPase  100 
 
 
179 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152627  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0527  NTPase  77.91 
 
 
179 aa  283  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3869  NTPase  78.36 
 
 
179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000951623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3675  NTPase  76.4 
 
 
179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0566  NTPase  74.72 
 
 
179 aa  278  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0816  NTPase  77.19 
 
 
180 aa  275  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3611  NTPase  76.61 
 
 
180 aa  274  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3483  NTPase  76.02 
 
 
180 aa  273  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4942  NTPase  57.89 
 
 
176 aa  208  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0555  NTPase  57.31 
 
 
171 aa  208  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4993  NTPase  57.89 
 
 
176 aa  207  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04270  NTPase  57.31 
 
 
173 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3662  NTPase  57.31 
 
 
173 aa  206  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4944  NTPase  57.31 
 
 
174 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4630  NTPase  57.65 
 
 
173 aa  205  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3603  protein of unknown function DUF84  57.06 
 
 
170 aa  204  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5909  NTPase  56.47 
 
 
173 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04235  hypothetical protein  56.8 
 
 
169 aa  201  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4942  NTPase  54.39 
 
 
171 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643685  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4994  NTPase  54.39 
 
 
171 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4996  NTPase  54.39 
 
 
171 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4908  NTPase  54.39 
 
 
171 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4835  NTPase  53.8 
 
 
171 aa  197  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01000  NTPase  52.12 
 
 
183 aa  177  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0232  NTPase  49.4 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004399  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  167  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0660  NTPase  46.39 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3918  NTPase  35.29 
 
 
198 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.472374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0917  NTPase  36.69 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3177  NTPase  36.05 
 
 
190 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0756  NTPase  34.68 
 
 
180 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2245  NTPase  36.78 
 
 
186 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3264  NTPase  35.5 
 
 
179 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3367  NTPase  35.5 
 
 
179 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0759  NTPase  35.5 
 
 
179 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.602659  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0857  NTPase  35.39 
 
 
189 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0738  NTPase  33.91 
 
 
205 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0862  NTPase  34.66 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0770  NTPase  31.03 
 
 
179 aa  97.4  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0859  NTPase  34.32 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2722  hypothetical protein  36.47 
 
 
183 aa  94.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.754344  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03969  NTPase  36.63 
 
 
193 aa  94  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2744  NTPase  35.39 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000885724  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0763  NTPase  33.14 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2774  NTPase  34.3 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0124832  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3676  NTPase  33.93 
 
 
186 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3554  NTPase  33.93 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0688  NTPase  35.93 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0894  cytidyltransferase-related domain protein  32.74 
 
 
320 aa  84  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0682  hypothetical protein  33.14 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0772299 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0603  protein of unknown function DUF84  33.56 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0778  hypothetical protein  32.93 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.108988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1629  protein of unknown function DUF84  35.71 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0050  protein of unknown function DUF84  30.17 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1315  hypothetical protein  33.53 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.48293 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1309  hypothetical protein  29.7 
 
 
216 aa  72  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0543493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1388  hypothetical protein  28.48 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1630  hypothetical protein  32.93 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0520  hypothetical protein  29.7 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1377  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  67.4  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4812  NTPase  28.66 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4828  NTPase  28.66 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0201611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4427  NTPase  28.66 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1248  hypothetical protein  27.88 
 
 
219 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.31896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4526  NTPase  30.06 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4445  NTPase  28.66 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275001  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2804  protein of unknown function DUF84  26.32 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4590  NTPase  28.22 
 
 
169 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000478498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0429  NTPase  28.83 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4946  NTPase  28.22 
 
 
169 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1392  hypothetical protein  30.73 
 
 
177 aa  60.8  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4807  NTPase  28.83 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4837  NTPase  28.22 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3356  NTPase  26.22 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0872  hypothetical protein  31.33 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1859  hypothetical protein  31.93 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0122  hypothetical protein  24.85 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0837  protein of unknown function DUF84  27.17 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>