79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0603 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0603  protein of unknown function DUF84  100 
 
 
197 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2804  protein of unknown function DUF84  50.95 
 
 
190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0837  protein of unknown function DUF84  45.88 
 
 
175 aa  131  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3918  NTPase  35.38 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.472374  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3177  NTPase  35.82 
 
 
190 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0862  NTPase  33.33 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0917  NTPase  33 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4942  NTPase  38 
 
 
176 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3603  protein of unknown function DUF84  36.24 
 
 
170 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4944  NTPase  36.24 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2245  NTPase  31.61 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0660  NTPase  30.05 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4993  NTPase  37.58 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4630  NTPase  36.24 
 
 
173 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3662  NTPase  36.24 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04270  NTPase  36.24 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0756  NTPase  32.65 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0770  NTPase  30.93 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0738  NTPase  32.32 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5909  NTPase  34.9 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0857  NTPase  29.8 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0682  hypothetical protein  46.21 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0772299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04235  hypothetical protein  35.81 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01000  NTPase  29.53 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3264  NTPase  34.25 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3367  NTPase  34.25 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4942  NTPase  35.57 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643685  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0688  NTPase  40.85 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4994  NTPase  35.57 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4908  NTPase  35.57 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4996  NTPase  35.57 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0759  NTPase  34.25 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.602659  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0859  NTPase  31 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4835  NTPase  34.9 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0555  NTPase  35.57 
 
 
171 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03969  NTPase  34.85 
 
 
193 aa  79  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2744  NTPase  39.86 
 
 
172 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000885724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1629  protein of unknown function DUF84  37.95 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3869  NTPase  31.33 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000951623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3554  NTPase  31.5 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3675  NTPase  31.33 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3676  NTPase  32.84 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0763  NTPase  31.5 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0677  NTPase  33.56 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152627  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0566  NTPase  32.88 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0527  NTPase  32.88 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0429  NTPase  30.46 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004399  hypothetical protein  32.14 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3356  NTPase  30.41 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4590  NTPase  30.46 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000478498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4946  NTPase  30.46 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1309  hypothetical protein  28.42 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0543493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0232  NTPase  32.86 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4445  NTPase  29.95 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4828  NTPase  30.46 
 
 
169 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0201611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4427  NTPase  29.95 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4812  NTPase  29.95 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4807  NTPase  29.95 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3611  NTPase  32.45 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0816  NTPase  33.11 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4526  NTPase  28.93 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4837  NTPase  29.95 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2774  NTPase  29.9 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0124832  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3483  NTPase  32.45 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2722  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.754344  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1377  hypothetical protein  27.89 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0050  protein of unknown function DUF84  28.35 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0520  hypothetical protein  27.51 
 
 
219 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1388  hypothetical protein  26.46 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0872  hypothetical protein  31.96 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0778  hypothetical protein  31.28 
 
 
169 aa  62.4  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.108988 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1248  hypothetical protein  25.93 
 
 
219 aa  62  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.31896  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0541  protein of unknown function DUF84  36.88 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.393243  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0894  cytidyltransferase-related domain protein  28.93 
 
 
320 aa  56.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0122  hypothetical protein  28.71 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1392  hypothetical protein  30.61 
 
 
177 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1630  hypothetical protein  29.59 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1859  hypothetical protein  32.49 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1315  hypothetical protein  28.5 
 
 
178 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.48293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>