79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0232 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0232  NTPase  100 
 
 		 174 aa  363  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004399  hypothetical protein  74.42 
 
 		 177 aa  277  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01000  NTPase  73.26 
 
 		 183 aa  271  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0660  NTPase  64.5 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3483  NTPase  53.29 
 
 		 180 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0816  NTPase  53.89 
 
 		 180 aa  187  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3611  NTPase  53.29 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3869  NTPase  51.19 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000951623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3675  NTPase  51.19 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0566  NTPase  50.6 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0677  NTPase  49.4 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152627  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0527  NTPase  48.21 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4996  NTPase  47.31 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4908  NTPase  47.31 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4835  NTPase  47.31 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4994  NTPase  47.31 
 
 		 171 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4942  NTPase  47.31 
 
 		 171 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0857  NTPase  45.76 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0917  NTPase  48.55 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2245  NTPase  48.86 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3662  NTPase  46.11 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04270  NTPase  46.11 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4944  NTPase  46.11 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4942  NTPase  45.51 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3603  protein of unknown function DUF84  46.11 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04235  hypothetical protein  46.11 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5909  NTPase  45.51 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0555  NTPase  46.71 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4993  NTPase  45.51 
 
 		 176 aa  161  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4630  NTPase  45.51 
 
 		 173 aa  160  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0862  NTPase  46.02 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3177  NTPase  47.16 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3918  NTPase  43.35 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.472374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0859  NTPase  47.46 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0770  NTPase  47.09 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0763  NTPase  46.59 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0759  NTPase  46.55 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.602659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3367  NTPase  46.55 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3264  NTPase  45.98 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3554  NTPase  44.89 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0738  NTPase  42.13 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3676  NTPase  44.32 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0756  NTPase  41.62 
 
 		 180 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2774  NTPase  42.53 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0124832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03969  NTPase  42.29 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2722  hypothetical protein  41.38 
 
 		 183 aa  127  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.754344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0894  cytidyltransferase-related domain protein  38.07 
 
 		 320 aa  105  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0682  hypothetical protein  40.24 
 
 		 189 aa  104  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0772299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2744  NTPase  36.97 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000885724  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1630  hypothetical protein  35.39 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0688  NTPase  32.7 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0050  protein of unknown function DUF84  34.88 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0778  hypothetical protein  36.14 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.108988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4812  NTPase  34.39 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4427  NTPase  34.39 
 
 		 169 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3356  NTPase  33.33 
 
 		 190 aa  84.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4828  NTPase  33.76 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0201611  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4445  NTPase  33.76 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4946  NTPase  33.76 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4590  NTPase  33.76 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000478498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0429  NTPase  33.12 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4526  NTPase  33.76 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4837  NTPase  33.12 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1315  hypothetical protein  31.07 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.48293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4807  NTPase  33.12 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1629  protein of unknown function DUF84  37.5 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0520  hypothetical protein  29.76 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1388  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0837  protein of unknown function DUF84  30.68 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1248  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.31896  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0603  protein of unknown function DUF84  32.86 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0122  hypothetical protein  31.36 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1377  hypothetical protein  27.38 
 
 		 219 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2804  protein of unknown function DUF84  33.16 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0872  hypothetical protein  28.74 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1309  hypothetical protein  25.88 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0543493  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1392  hypothetical protein  27.71 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0541  protein of unknown function DUF84  31.21 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.393243  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1859  hypothetical protein  30.36 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>