79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0682 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0682  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  360  5.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0772299 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2722  hypothetical protein  47.02 
 
 
183 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.754344  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0660  NTPase  37.65 
 
 
173 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2774  NTPase  39.64 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0124832  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01000  NTPase  38.95 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004399  hypothetical protein  37.57 
 
 
177 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0756  NTPase  35.5 
 
 
180 aa  111  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0857  NTPase  37.64 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0232  NTPase  40.24 
 
 
174 aa  104  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3264  NTPase  35.67 
 
 
179 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0917  NTPase  35.67 
 
 
179 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0759  NTPase  35.09 
 
 
179 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.602659  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3367  NTPase  35.09 
 
 
179 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0555  NTPase  39.88 
 
 
171 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0738  NTPase  32.11 
 
 
205 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3177  NTPase  34.48 
 
 
190 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2245  NTPase  36.63 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0770  NTPase  34.32 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03969  NTPase  37.5 
 
 
193 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3662  NTPase  38.86 
 
 
173 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4944  NTPase  38.86 
 
 
174 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3603  protein of unknown function DUF84  38.86 
 
 
170 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04270  NTPase  38.86 
 
 
173 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04235  hypothetical protein  38.86 
 
 
169 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4942  NTPase  38.29 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4630  NTPase  38.29 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4993  NTPase  38.29 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5909  NTPase  37.71 
 
 
173 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3676  NTPase  33.91 
 
 
186 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3918  NTPase  34.5 
 
 
198 aa  95.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.472374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4942  NTPase  38.6 
 
 
171 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643685  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4994  NTPase  38.6 
 
 
171 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4996  NTPase  38.6 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4908  NTPase  38.6 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4835  NTPase  38.01 
 
 
171 aa  94.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3554  NTPase  33.33 
 
 
186 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0763  NTPase  32.97 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3869  NTPase  36.84 
 
 
179 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000951623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0859  NTPase  33.33 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0862  NTPase  34.48 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3675  NTPase  36.26 
 
 
179 aa  89  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0527  NTPase  36.63 
 
 
179 aa  87  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0688  NTPase  40.12 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2744  NTPase  36.36 
 
 
172 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000885724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2804  protein of unknown function DUF84  40.22 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0603  protein of unknown function DUF84  46.21 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0566  NTPase  35.8 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1629  protein of unknown function DUF84  40.94 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1309  hypothetical protein  26.32 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0543493  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0894  cytidyltransferase-related domain protein  33.14 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0520  hypothetical protein  29.94 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0778  hypothetical protein  37.5 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.108988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4526  NTPase  35.19 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0429  NTPase  35.19 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0816  NTPase  34.91 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3356  NTPase  34.57 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3483  NTPase  34.32 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3611  NTPase  34.32 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1388  hypothetical protein  28.14 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0677  NTPase  33.14 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152627  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4590  NTPase  34.57 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000478498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4946  NTPase  34.57 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4445  NTPase  34.57 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1248  hypothetical protein  28.74 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.31896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4807  NTPase  35.19 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4812  NTPase  34.57 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4837  NTPase  34.57 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4828  NTPase  34.57 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0201611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0541  protein of unknown function DUF84  37.87 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.393243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4427  NTPase  33.95 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0050  protein of unknown function DUF84  27.12 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1630  hypothetical protein  33.91 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0837  protein of unknown function DUF84  40 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1377  hypothetical protein  28.74 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0122  hypothetical protein  30.18 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1392  hypothetical protein  32.74 
 
 
177 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0872  hypothetical protein  33.73 
 
 
177 aa  61.2  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1315  hypothetical protein  29.34 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.48293 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1859  hypothetical protein  32.34 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>