15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2498 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2498  putative fimbrial subunit protein  100 
 
 		 177 aa  360  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2341  putative fimbrial subunit protein  98.87 
 
 		 177 aa  357  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2390  putative fimbrial protein protein  97.74 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2386  fimbrial protein  51.38 
 
 		 176 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.632463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2297  putative fimbrial subunit protein  49.72 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.801362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2247  fimbrial protein  33.87 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0358977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1546  Fimbrial protein  33.87 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.358658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1536  fimbrial protein  33.87 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2402  fimbrial protein  33.87 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0932  fimbrial protein  33.87 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.85324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3094  fimbrial protein  33.33 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.989745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0853  fimbrial protein  32.8 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.548581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0024  putative fimbrial protein  35.68 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  25.57 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  28.73 
 
 		 179 aa  40.8  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>