14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1546 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1546  Fimbrial protein  100 
 
 		 180 aa  361  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.358658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1536  fimbrial protein  100 
 
 		 180 aa  361  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2402  fimbrial protein  99.44 
 
 		 180 aa  360  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0932  fimbrial protein  99.44 
 
 		 180 aa  360  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.85324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2247  fimbrial protein  99.44 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0358977  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3094  fimbrial protein  85.56 
 
 		 180 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.989745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0853  fimbrial protein  83.89 
 
 		 180 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.548581  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2341  putative fimbrial subunit protein  33.87 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2498  putative fimbrial subunit protein  33.87 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2390  putative fimbrial protein protein  33.87 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2386  fimbrial protein  33.7 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.632463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2297  putative fimbrial subunit protein  32.07 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.801362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0024  putative fimbrial protein  26.67 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  27.43 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>