13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2390 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2390  putative fimbrial protein protein  100 
 
 
177 aa  360  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2498  putative fimbrial subunit protein  97.74 
 
 
177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399602  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2341  putative fimbrial subunit protein  97.74 
 
 
177 aa  353  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2386  fimbrial protein  51.38 
 
 
176 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.632463  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2297  putative fimbrial subunit protein  50.83 
 
 
176 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.801362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2247  fimbrial protein  33.87 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0358977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1546  Fimbrial protein  33.87 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.358658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1536  fimbrial protein  33.87 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2402  fimbrial protein  33.87 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0932  fimbrial protein  33.87 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.85324  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3094  fimbrial protein  33.87 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.989745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0853  fimbrial protein  33.33 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.548581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0024  putative fimbrial protein  35.68 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal 
 
 
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