14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2386 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2386  fimbrial protein  100 
 
 		 176 aa  358  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.632463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2297  putative fimbrial subunit protein  97.16 
 
 		 176 aa  348  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.801362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2341  putative fimbrial subunit protein  52.49 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2498  putative fimbrial subunit protein  51.38 
 
 		 177 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2390  putative fimbrial protein protein  51.38 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0024  putative fimbrial protein  35.2 
 
 		 177 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2247  fimbrial protein  33.7 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0358977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1546  Fimbrial protein  33.7 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.358658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1536  fimbrial protein  33.7 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2402  fimbrial protein  33.7 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0932  fimbrial protein  33.7 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.85324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0853  fimbrial protein  32.07 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.548581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3094  fimbrial protein  32.07 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.989745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  28.49 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>