74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1442 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1442  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
132 aa  271  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.494715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1183  NADPH-dependent FMN reductase  42.99 
 
 
162 aa  94  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1845  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.8 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5295  FMN reductase, NADPH-dependent  36.11 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4857  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  36.11 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5027  FMN reductase, NADPH-dependent  35.19 
 
 
181 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5265  FMN reductase, NADPH-dependent  35.19 
 
 
181 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5408  FMN reductase, NADPH-dependent  35.19 
 
 
181 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5662  FMN reductase, NADPH-dependent  36.11 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5340  FMN reductase, NADPH-dependent  36.11 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4872  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  36.11 
 
 
181 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4971  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.04 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5282  FMN reductase, NADPH-dependent  33.33 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  34.91 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0624  hypothetical protein  31.73 
 
 
178 aa  57  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0639  hypothetical protein  31.73 
 
 
178 aa  57  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  31.9 
 
 
192 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0333  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.85 
 
 
222 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
191 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  30.83 
 
 
204 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
201 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  27 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.08 
 
 
193 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  28.45 
 
 
186 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1636  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
214 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  29.29 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 
188 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  43.18 
 
 
224 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
217 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
191 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1202  hypothetical protein  28.3 
 
 
195 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727193  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0629  multimeric flavodoxin WrbA-like  28.23 
 
 
226 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.155338  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 
220 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  23.47 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
206 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
200 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  47.62 
 
 
222 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 
207 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1108  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
252 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  30.19 
 
 
263 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 
193 aa  42  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  26.53 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
211 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  27.27 
 
 
179 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  22.12 
 
 
185 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.19 
 
 
207 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
224 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  31.4 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0553  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.73 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0765558  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  32.26 
 
 
189 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  22 
 
 
208 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  22 
 
 
210 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  26.26 
 
 
195 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  27.88 
 
 
262 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  29.17 
 
 
250 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
224 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  34.78 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
193 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 
189 aa  40  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  31.31 
 
 
194 aa  40.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  31.96 
 
 
195 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 
204 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3148  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
211 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  28.28 
 
 
182 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>