30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3990 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3990  acetoacetyl-CoA synthase  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.739311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  65.43 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1252  post-segregation antitoxin CcdA  46.15 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000539049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0217  post-segregation antitoxin CcdA  47.22 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1731  Post-segregation antitoxin CcdA  47.44 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2487  Post-segregation antitoxin CcdA  44.87 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1474  Post-segregation antitoxin CcdA  48.57 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1554  post-segregation antitoxin CcdA  47.14 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1253  Post-segregation antitoxin CcdA  48.57 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3184  post-segregation antitoxin CcdA  43.06 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1256  post-segregation antitoxin CcdA  47.37 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.643497  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0053  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.563576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2988  potential post-segregation antitoxin  36 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7280  post-segregation antitoxin CcdA  38.89 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427853  normal  0.0277353 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3553  hypothetical protein  35.62 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4793  hypothetical protein  33.8 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.954907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4875  hypothetical protein  33.8 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.894566  hitchhiker  0.00893585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4744  hypothetical protein  33.8 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2664  hypothetical protein  36.62 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3371  post-segregation antitoxin CcdA  32.05 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4519  hypothetical protein  33.8 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.40075  normal  0.09413 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2582  hypothetical protein  31.51 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4254  hypothetical protein  32.39 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0037  plasmid maintenance protein CcdA  27.54 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.842292 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0251  plasmid maintenance protein CcdA  27.54 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0049  plasmid maintenance protein CcdA  26.76 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0034  plasmid maintenance protein CcdA  26.76 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0057  plasmid maintenance protein CcdA  26.76 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3104  plasmid maintenance protein CcdA  27.54 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3416  plasmid maintenance protein CcdA  27.54 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>