14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3553 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3553  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  167  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4254  hypothetical protein  49.3 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4519  hypothetical protein  47.22 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.40075  normal  0.09413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3184  post-segregation antitoxin CcdA  37.5 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2664  hypothetical protein  43.66 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7280  post-segregation antitoxin CcdA  37.8 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427853  normal  0.0277353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2988  potential post-segregation antitoxin  34.67 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  34.67 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0217  post-segregation antitoxin CcdA  38.89 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1256  post-segregation antitoxin CcdA  30 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.643497  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1252  post-segregation antitoxin CcdA  32.43 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000539049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3990  acetoacetyl-CoA synthase  35.62 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.739311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3371  post-segregation antitoxin CcdA  33.78 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2582  hypothetical protein  40.32 
 
 		 87 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>