16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4519 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4519  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.40075  normal  0.09413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4254  hypothetical protein  84.21 
 
 		 76 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2664  hypothetical protein  52.63 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3553  hypothetical protein  47.22 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7280  post-segregation antitoxin CcdA  49.3 
 
 		 80 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427853  normal  0.0277353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3184  post-segregation antitoxin CcdA  40.54 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  36.62 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4238  hypothetical protein  45.07 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131042  normal  0.541615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1256  post-segregation antitoxin CcdA  38.24 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.643497  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2988  potential post-segregation antitoxin  29.73 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1252  post-segregation antitoxin CcdA  35.21 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000539049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0217  post-segregation antitoxin CcdA  35.14 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2487  Post-segregation antitoxin CcdA  34.67 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2582  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1731  Post-segregation antitoxin CcdA  34.67 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1554  post-segregation antitoxin CcdA  28.38 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>