18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2582 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2582  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  175  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2664  hypothetical protein  47.69 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7280  post-segregation antitoxin CcdA  50.77 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427853  normal  0.0277353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1252  post-segregation antitoxin CcdA  43.75 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000539049  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4519  hypothetical protein  44.44 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.40075  normal  0.09413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0217  post-segregation antitoxin CcdA  41.94 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4254  hypothetical protein  43.06 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2487  Post-segregation antitoxin CcdA  37.5 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1731  Post-segregation antitoxin CcdA  37.5 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3553  hypothetical protein  40.32 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1256  post-segregation antitoxin CcdA  32.31 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.643497  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4238  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131042  normal  0.541615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1253  Post-segregation antitoxin CcdA  30.88 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1554  post-segregation antitoxin CcdA  30.16 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1474  Post-segregation antitoxin CcdA  30.51 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2988  potential post-segregation antitoxin  32.2 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  29.69 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3184  post-segregation antitoxin CcdA  29.03 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>