31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1554 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1554  post-segregation antitoxin CcdA  100 
 
 		 78 aa  163  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1474  Post-segregation antitoxin CcdA  82.05 
 
 		 78 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1253  Post-segregation antitoxin CcdA  82.05 
 
 		 78 aa  135  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0053  hypothetical protein  63.51 
 
 		 77 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.563576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4875  hypothetical protein  49.37 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.894566  hitchhiker  0.00893585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4793  hypothetical protein  51.28 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.954907  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4744  hypothetical protein  51.28 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  42.86 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0217  post-segregation antitoxin CcdA  41.03 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1731  Post-segregation antitoxin CcdA  45.71 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1252  post-segregation antitoxin CcdA  44.29 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000539049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0496  plasmid maintenance protein CcdA  36.76 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3543  plasmid maintenance protein CcdA  36.76 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3990  acetoacetyl-CoA synthase  47.14 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.739311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0854  plasmid maintenance protein CcdA  36.76 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3104  plasmid maintenance protein CcdA  35.29 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3416  plasmid maintenance protein CcdA  35.29 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2487  Post-segregation antitoxin CcdA  41.43 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3039  plasmid maintenance protein CcdA  33.82 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2988  potential post-segregation antitoxin  32.43 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4254  hypothetical protein  31.08 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3184  post-segregation antitoxin CcdA  32.86 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0251  plasmid maintenance protein CcdA  27.14 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1256  post-segregation antitoxin CcdA  33.82 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.643497  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7280  post-segregation antitoxin CcdA  34.25 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427853  normal  0.0277353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2664  hypothetical protein  27.63 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3371  post-segregation antitoxin CcdA  30.14 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4519  hypothetical protein  28.38 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.40075  normal  0.09413 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0057  plasmid maintenance protein CcdA  27.14 
 
 		 72 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0034  plasmid maintenance protein CcdA  27.14 
 
 		 72 aa  40  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0049  plasmid maintenance protein CcdA  27.94 
 
 		 72 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>