24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0217 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0217  post-segregation antitoxin CcdA  100 
 
 		 75 aa  146  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1252  post-segregation antitoxin CcdA  63.89 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000539049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1731  Post-segregation antitoxin CcdA  54.17 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2487  Post-segregation antitoxin CcdA  50 
 
 		 82 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  45.33 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1256  post-segregation antitoxin CcdA  44.12 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.643497  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3990  acetoacetyl-CoA synthase  47.22 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.739311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1554  post-segregation antitoxin CcdA  41.03 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1474  Post-segregation antitoxin CcdA  42.86 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1253  Post-segregation antitoxin CcdA  42.86 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2988  potential post-segregation antitoxin  38.67 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2582  hypothetical protein  41.94 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3553  hypothetical protein  38.89 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3184  post-segregation antitoxin CcdA  36.11 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7280  post-segregation antitoxin CcdA  35.38 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427853  normal  0.0277353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2664  hypothetical protein  35.21 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.563576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4793  hypothetical protein  35.21 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.954907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4875  hypothetical protein  35.21 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.894566  hitchhiker  0.00893585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4744  hypothetical protein  35.21 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4519  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.40075  normal  0.09413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3371  post-segregation antitoxin CcdA  37.5 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4254  hypothetical protein  36.62 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0049  plasmid maintenance protein CcdA  28.79 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>