21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3184 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3184  post-segregation antitoxin CcdA  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  45.33 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3553  hypothetical protein  37.5 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2664  hypothetical protein  45.07 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4519  hypothetical protein  40.54 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.40075  normal  0.09413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4254  hypothetical protein  42.25 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2487  Post-segregation antitoxin CcdA  38.36 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7280  post-segregation antitoxin CcdA  38.89 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427853  normal  0.0277353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1731  Post-segregation antitoxin CcdA  36.99 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1252  post-segregation antitoxin CcdA  36.99 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000539049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3990  acetoacetyl-CoA synthase  43.06 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.739311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2988  potential post-segregation antitoxin  30.67 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1256  post-segregation antitoxin CcdA  33.75 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.643497  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0217  post-segregation antitoxin CcdA  36.11 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4793  hypothetical protein  33.8 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.954907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4875  hypothetical protein  33.8 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.894566  hitchhiker  0.00893585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4744  hypothetical protein  33.8 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1474  Post-segregation antitoxin CcdA  34.25 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1554  post-segregation antitoxin CcdA  32.86 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0053  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.563576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1253  Post-segregation antitoxin CcdA  30 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>