27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4744 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4744  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4793  hypothetical protein  98.73 
 
 		 79 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.954907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4875  hypothetical protein  97.47 
 
 		 79 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.894566  hitchhiker  0.00893585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1554  post-segregation antitoxin CcdA  51.28 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1474  Post-segregation antitoxin CcdA  49.32 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1253  Post-segregation antitoxin CcdA  48.72 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0053  hypothetical protein  45.21 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.563576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  42.25 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0496  plasmid maintenance protein CcdA  35.21 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1731  Post-segregation antitoxin CcdA  36.62 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3543  plasmid maintenance protein CcdA  35.21 
 
 		 72 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0854  plasmid maintenance protein CcdA  35.21 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3104  plasmid maintenance protein CcdA  33.8 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3039  plasmid maintenance protein CcdA  33.8 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0251  plasmid maintenance protein CcdA  29.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3416  plasmid maintenance protein CcdA  33.8 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1252  post-segregation antitoxin CcdA  38.03 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000539049  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3184  post-segregation antitoxin CcdA  33.8 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2487  Post-segregation antitoxin CcdA  33.8 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0049  plasmid maintenance protein CcdA  29.58 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0217  post-segregation antitoxin CcdA  35.21 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0034  plasmid maintenance protein CcdA  28.17 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7280  post-segregation antitoxin CcdA  32.39 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427853  normal  0.0277353 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0057  plasmid maintenance protein CcdA  28.17 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0037  plasmid maintenance protein CcdA  26.76 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.842292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2988  potential post-segregation antitoxin  29.58 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4254  hypothetical protein  30.26 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>