19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0854 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0854  plasmid maintenance protein CcdA  100 
 
 
72 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0496  plasmid maintenance protein CcdA  97.22 
 
 
72 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3543  plasmid maintenance protein CcdA  94.44 
 
 
72 aa  140  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3416  plasmid maintenance protein CcdA  95.83 
 
 
72 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3104  plasmid maintenance protein CcdA  94.44 
 
 
72 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3039  plasmid maintenance protein CcdA  93.06 
 
 
72 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0251  plasmid maintenance protein CcdA  63.89 
 
 
72 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0049  plasmid maintenance protein CcdA  66.67 
 
 
72 aa  103  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0034  plasmid maintenance protein CcdA  65.28 
 
 
72 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0057  plasmid maintenance protein CcdA  65.28 
 
 
72 aa  103  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0037  plasmid maintenance protein CcdA  63.89 
 
 
72 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.842292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1554  post-segregation antitoxin CcdA  36.76 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4875  hypothetical protein  35.21 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.894566  hitchhiker  0.00893585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4793  hypothetical protein  35.21 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.954907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1474  Post-segregation antitoxin CcdA  35.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4744  hypothetical protein  35.21 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1253  Post-segregation antitoxin CcdA  32.35 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  29.58 
 
 
81 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0053  hypothetical protein  30.88 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.563576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>