20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0037 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0037  plasmid maintenance protein CcdA  100 
 
 		 72 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.842292 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0057  plasmid maintenance protein CcdA  90.28 
 
 		 72 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0034  plasmid maintenance protein CcdA  90.28 
 
 		 72 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0049  plasmid maintenance protein CcdA  88.89 
 
 		 72 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0251  plasmid maintenance protein CcdA  79.17 
 
 		 72 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3104  plasmid maintenance protein CcdA  65.28 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3416  plasmid maintenance protein CcdA  65.28 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0854  plasmid maintenance protein CcdA  63.89 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0496  plasmid maintenance protein CcdA  63.89 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3543  plasmid maintenance protein CcdA  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3039  plasmid maintenance protein CcdA  62.5 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1474  Post-segregation antitoxin CcdA  35.71 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2487  Post-segregation antitoxin CcdA  30.99 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1731  Post-segregation antitoxin CcdA  28.17 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1253  Post-segregation antitoxin CcdA  30 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0053  hypothetical protein  30 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.563576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4875  hypothetical protein  26.76 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.894566  hitchhiker  0.00893585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4793  hypothetical protein  26.76 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.954907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  26.76 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4744  hypothetical protein  26.76 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0589295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>