31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1795 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  709    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  29.3 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  23.17 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000050026  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0697  hypothetical protein  20.83 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  25.37 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  25.37 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  25.37 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000771271  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  24.08 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  22.84 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  24.88 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000906332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  60.61 
 
 		 222 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2138  putative lipoprotein  38.89 
 
 		 565 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  23.87 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000100473  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  60 
 
 		 268 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2156  hypothetical protein  27.78 
 
 		 209 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  34.85 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000117038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1664  hypothetical protein  27.71 
 
 		 190 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  20.33 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  22.1 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1329  hypothetical protein  53.57 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.50236  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25220  hypothetical protein  29.58 
 
 		 209 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1592  hypothetical protein  27.36 
 
 		 173 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.722973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  23.62 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  46.67 
 
 		 208 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000681695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1688  hypothetical protein  26.76 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374409  normal  0.176627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3595  hypothetical protein  26.67 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2147  hypothetical protein  26.67 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.367582  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  53.57 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000014454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3867  hypothetical protein  25.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02438  hypothetical protein  31.51 
 
 		 509 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.477602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>