14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2147 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2147  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.367582  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3595  hypothetical protein  98.95 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1688  hypothetical protein  94.74 
 
 		 190 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374409  normal  0.176627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1664  hypothetical protein  90 
 
 		 190 aa  323  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3867  hypothetical protein  57.45 
 
 		 188 aa  223  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2100  hypothetical protein  52.3 
 
 		 174 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.602321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1895  hypothetical protein  51.85 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.609081  normal  0.30639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14560  hypothetical protein  49.37 
 
 		 174 aa  151  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25220  hypothetical protein  47.12 
 
 		 209 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2156  hypothetical protein  46.6 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1592  hypothetical protein  40.25 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.722973 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1175  hypothetical protein  26.71 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0859  hypothetical protein  26.71 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.572986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  26.76 
 
 		 344 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>