18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25220 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_25220  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2156  hypothetical protein  97.61 
 
 
209 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3867  hypothetical protein  48.95 
 
 
188 aa  184  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14560  hypothetical protein  51.92 
 
 
174 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2100  hypothetical protein  47.7 
 
 
174 aa  174  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.602321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1592  hypothetical protein  50.62 
 
 
173 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.722973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1895  hypothetical protein  45.4 
 
 
174 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.609081  normal  0.30639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1664  hypothetical protein  46.84 
 
 
190 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2147  hypothetical protein  47.12 
 
 
190 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.367582  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3595  hypothetical protein  46.6 
 
 
190 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1688  hypothetical protein  46.6 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374409  normal  0.176627 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1175  hypothetical protein  28.66 
 
 
168 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0859  hypothetical protein  28.66 
 
 
168 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.572986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  33.52 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1778  hypothetical protein  25.26 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1777  hypothetical protein  24.74 
 
 
184 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  25.74 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000681695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  29.58 
 
 
344 aa  45.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>