17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14560 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_14560  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  347  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2100  hypothetical protein  51.15 
 
 
174 aa  187  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.602321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3867  hypothetical protein  50.57 
 
 
188 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1895  hypothetical protein  50.62 
 
 
174 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.609081  normal  0.30639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25220  hypothetical protein  51.66 
 
 
209 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2156  hypothetical protein  50.99 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1592  hypothetical protein  49.69 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.722973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1664  hypothetical protein  53.45 
 
 
190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2147  hypothetical protein  52.27 
 
 
190 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.367582  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3595  hypothetical protein  52.27 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1688  hypothetical protein  52.84 
 
 
190 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374409  normal  0.176627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1777  hypothetical protein  26.6 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1778  hypothetical protein  26.6 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1175  hypothetical protein  24.84 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0859  hypothetical protein  24.84 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.572986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  30.57 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>