16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2100 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2100  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  357  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.602321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1895  hypothetical protein  88.34 
 
 		 174 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.609081  normal  0.30639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3867  hypothetical protein  60.34 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2147  hypothetical protein  52.3 
 
 		 190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.367582  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3595  hypothetical protein  52.3 
 
 		 190 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14560  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1688  hypothetical protein  51.72 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374409  normal  0.176627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1664  hypothetical protein  51.15 
 
 		 190 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1592  hypothetical protein  46.58 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.722973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25220  hypothetical protein  47.7 
 
 		 209 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2156  hypothetical protein  47.13 
 
 		 209 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1934  hypothetical protein  29.25 
 
 		 264 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1777  hypothetical protein  24.73 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1778  hypothetical protein  25.13 
 
 		 184 aa  42  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  20.55 
 
 		 344 aa  41.2  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  27.98 
 
 		 222 aa  41.2  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>