19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2156 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2156  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25220  hypothetical protein  97.61 
 
 
209 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3867  hypothetical protein  48.42 
 
 
188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14560  hypothetical protein  51.28 
 
 
174 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2100  hypothetical protein  47.13 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.602321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1592  hypothetical protein  50.62 
 
 
173 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.722973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1895  hypothetical protein  44.79 
 
 
174 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.609081  normal  0.30639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1664  hypothetical protein  46.32 
 
 
190 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2147  hypothetical protein  46.6 
 
 
190 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.367582  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3595  hypothetical protein  46.07 
 
 
190 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1688  hypothetical protein  46.07 
 
 
190 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374409  normal  0.176627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  34.64 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1175  hypothetical protein  28.03 
 
 
168 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0859  hypothetical protein  28.03 
 
 
168 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.572986  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1778  hypothetical protein  25.26 
 
 
184 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1777  hypothetical protein  24.74 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  27.78 
 
 
344 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  25.74 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000681695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1357  hypothetical protein  31.17 
 
 
246 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>