28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1167 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  423  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000681695  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0859  hypothetical protein  25.13 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.572986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  27.23 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1175  hypothetical protein  25.13 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  21.74 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  35.45 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  26.07 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1592  hypothetical protein  26.74 
 
 		 173 aa  52  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.722973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  32.43 
 
 		 343 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  20.85 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  32.1 
 
 		 312 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000100473  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2834  hypothetical protein  28.72 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000562067  hitchhiker  0.000583548 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  21.89 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  31.82 
 
 		 341 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  31.82 
 
 		 342 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  48.5  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000041783  normal  0.218366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  27.47 
 
 		 335 aa  48.5  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000050026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  34.88 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000014454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  30.95 
 
 		 382 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000117038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  29.76 
 
 		 333 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000771271  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  32.94 
 
 		 336 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  23.26 
 
 		 333 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000906332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  29.76 
 
 		 333 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25220  hypothetical protein  24.42 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  29.76 
 
 		 333 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2156  hypothetical protein  24.42 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  46.67 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  29.76 
 
 		 475 aa  42.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>