28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1629 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1629  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000041783  normal  0.218366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  54.14 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000100473  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2834  hypothetical protein  51.58 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000562067  hitchhiker  0.000583548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  48.32 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000050026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  41.56 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000014454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  40.8 
 
 		 382 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000117038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  39.88 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  38.12 
 
 		 341 aa  228  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  38.3 
 
 		 342 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  38.55 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  38.44 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000771271  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  38.08 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  38.44 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  38.12 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000906332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  37.73 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1329  hypothetical protein  34.88 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.50236  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  29.55 
 
 		 243 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  29.55 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  28.22 
 
 		 266 aa  92.4  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  24.53 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0697  hypothetical protein  27.9 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  24.9 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2138  putative lipoprotein  33.66 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02438  hypothetical protein  29.79 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.477602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1357  hypothetical protein  26.7 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  24.75 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000681695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>