18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1592 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1592  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.722973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2100  hypothetical protein  46.55 
 
 		 174 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.602321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25220  hypothetical protein  50.99 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2156  hypothetical protein  50.99 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14560  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  157  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1895  hypothetical protein  44.17 
 
 		 174 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.609081  normal  0.30639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3867  hypothetical protein  41.38 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1664  hypothetical protein  40.91 
 
 		 190 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2147  hypothetical protein  38.96 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.367582  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3595  hypothetical protein  38.96 
 
 		 190 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1688  hypothetical protein  38.96 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374409  normal  0.176627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  26.74 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000681695  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1175  hypothetical protein  26.09 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0859  hypothetical protein  26.09 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.572986  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1777  hypothetical protein  27.72 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1778  hypothetical protein  27.72 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  27.36 
 
 		 344 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  27.22 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>