26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2138 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2138  putative lipoprotein  100 
 
 		 565 aa  1165    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129956  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  36.28 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  37.5 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  36.61 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1329  hypothetical protein  32.48 
 
 		 394 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.50236  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  36.54 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2834  hypothetical protein  39.18 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000562067  hitchhiker  0.000583548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  38.14 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000906332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  39.25 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  38.54 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000771271  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  38.54 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  37.5 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000100473  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000050026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  37.25 
 
 		 382 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000117038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1629  hypothetical protein  33.66 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000041783  normal  0.218366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  36.08 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  35 
 
 		 254 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  39.05 
 
 		 330 aa  67  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000014454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  23.55 
 
 		 475 aa  66.6  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02438  hypothetical protein  30.84 
 
 		 509 aa  57  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.477602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  28.43 
 
 		 242 aa  50.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  38.89 
 
 		 344 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  27.45 
 
 		 243 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0697  hypothetical protein  24.58 
 
 		 296 aa  47.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147007  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  27 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  26.6 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>