107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4906 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4906    100 
 
 		 126 bp  250  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000543132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    98.41 
 
 		 3433 bp  234  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    97.62 
 
 		 1023 bp  226  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0854    97.62 
 
 		 1511 bp  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    97.62 
 
 		 1589 bp  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0279    97.62 
 
 		 126 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0094    97.62 
 
 		 126 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0013    97.62 
 
 		 126 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0046    97.62 
 
 		 126 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00544    96.83 
 
 		 1386 bp  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    96.83 
 
 		 1550 bp  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    96.83 
 
 		 1837 bp  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    96.83 
 
 		 1379 bp  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2785    99.12 
 
 		 114 bp  216  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3802    99.12 
 
 		 114 bp  216  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.641895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4563    99.12 
 
 		 114 bp  216  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4621    99.12 
 
 		 114 bp  216  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.297347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0247    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0282    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0286    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0435    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.376872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0458    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.864963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0505    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0545    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0622    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0703    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0227722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0788    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000263328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0797    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0737948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0851    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.652231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0861    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.860797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0869    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0874    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0948    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.144932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0959    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00484972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1073    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000372358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1102    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1224    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.220773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1234    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1410    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.177139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1550    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1802    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1828    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1874    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000718283  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1942    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1989    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2008    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2189    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0016526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2299    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2310    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2312    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2428    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2455    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.286344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2495    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2583    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2585    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2630    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2840    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2914    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.217999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3116    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3197    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3230  putative IS1 encoded protein  98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3256    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3305    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3452    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3474    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3532    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3816    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3834    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3838    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3920    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.874838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4011    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4012    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4118    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000104629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4217  putative IS1 encoded protein  98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4259    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4276    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4282    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4299    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4355    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4479    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4519    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4528    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4601    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4712    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4731    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.431885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4781    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4784    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4806    98.23 
 
 		 114 bp  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    95.93 
 
 		 1218 bp  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    95.93 
 
 		 1668 bp  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3598    95.93 
 
 		 1370 bp  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.25982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4800    95.93 
 
 		 860 bp  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4894    95.93 
 
 		 2105 bp  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0821    97.35 
 
 		 114 bp  200  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.900225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3342    97.35 
 
 		 114 bp  200  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0765    98.11 
 
 		 114 bp  194  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0908  ShiE  96.43 
 
 		 186 bp  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0561  putative IS1 encoded protein  95.24 
 
 		 225 bp  135  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000545935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0750  transposase  95.24 
 
 		 207 bp  135  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3014  putative IS1 encoded protein  95.24 
 
 		 198 bp  135  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>