107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0013 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3330    100 
 
 		 1023 bp  250  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0854    100 
 
 		 1511 bp  250  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    100 
 
 		 1589 bp  250  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0279    100 
 
 		 126 bp  250  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0094    100 
 
 		 126 bp  250  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0013    100 
 
 		 126 bp  250  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0046    100 
 
 		 126 bp  250  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00544    99.21 
 
 		 1386 bp  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    99.21 
 
 		 1550 bp  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    99.21 
 
 		 1837 bp  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    99.21 
 
 		 1379 bp  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    99.21 
 
 		 3433 bp  242  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0247    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0282    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0286    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0435    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.376872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0458    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.864963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0505    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0545    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0622    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0703    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0227722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0788    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000263328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0797    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0737948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0851    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.652231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0861    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.860797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0869    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0874    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0948    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.144932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0959    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00484972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1073    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000372358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1102    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1224    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.220773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1234    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1410    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.177139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1550    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1802    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1828    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1874    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000718283  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1942    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1989    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2008    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2189    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0016526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2299    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2310    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2312    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2428    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2455    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.286344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2495    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2583    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2585    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2630    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2840    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2914    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.217999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3116    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3197    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3230  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3256    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3305    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3452    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3474    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3532    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3816    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3834    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3838    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3920    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.874838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4011    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4012    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4118    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000104629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4217  putative IS1 encoded protein  100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4259    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4276    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4282    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4299    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4355    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4479    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4519    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4528    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4601    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4712    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4731    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.431885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4781    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4784    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4806    100 
 
 		 114 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4906    97.62 
 
 		 126 bp  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000543132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0821    99.12 
 
 		 114 bp  218  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.900225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2785    99.12 
 
 		 114 bp  218  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3342    99.12 
 
 		 114 bp  218  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3802    99.12 
 
 		 114 bp  218  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.641895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4563    99.12 
 
 		 114 bp  218  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4621    99.12 
 
 		 114 bp  218  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.297347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0765    98.25 
 
 		 114 bp  210  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    95.12 
 
 		 1218 bp  196  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    95.12 
 
 		 1668 bp  196  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3598    95.12 
 
 		 1370 bp  196  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.25982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4800    95.12 
 
 		 860 bp  196  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4894    95.12 
 
 		 2105 bp  196  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0908  ShiE  97.62 
 
 		 186 bp  151  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0561  putative IS1 encoded protein  96.43 
 
 		 225 bp  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000545935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0750  transposase  96.43 
 
 		 207 bp  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3014  putative IS1 encoded protein  96.43 
 
 		 198 bp  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>