107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2785 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2785    100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2789    100 
 
 		 3433 bp  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.362775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3802    100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.641895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4563    100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4621    100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.297347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3330    99.12 
 
 		 1023 bp  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.284553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0854    99.12 
 
 		 1511 bp  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1611    99.12 
 
 		 1589 bp  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0247    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0282    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0286    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0435    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.376872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0458    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.864963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0505    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0545    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0622    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0703    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0227722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0788    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000263328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0797    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0737948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0851    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.652231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0861    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.860797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0869    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0874    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0948    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.144932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0959    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00484972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1073    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000372358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1102    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1224    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.220773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1234    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1410    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.177139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1550    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1802    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1828    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1874    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000718283  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1942    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1989    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2008    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2189    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0016526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2299    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2310    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2312    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2428    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2455    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.286344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2495    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2583    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2585    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2630    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2840    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2914    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.217999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3116    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3197    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3230  putative IS1 encoded protein  99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3256    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3305    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3452    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3474    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3532    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0279    99.12 
 
 		 126 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3816    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3834    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3838    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3920    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.874838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4011    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4012    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4118    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000104629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4217  putative IS1 encoded protein  99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4259    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4276    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4282    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4299    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4355    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4479    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4519    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4528    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0094    99.12 
 
 		 126 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4601    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4712    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4731    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.431885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4781    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4784    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4806    99.12 
 
 		 114 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0013    99.12 
 
 		 126 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0046    99.12 
 
 		 126 bp  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4906    99.12 
 
 		 126 bp  216  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000543132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00544    98.25 
 
 		 1386 bp  210  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02016    98.25 
 
 		 1550 bp  210  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02269    98.25 
 
 		 1837 bp  210  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04179    98.25 
 
 		 1379 bp  210  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.894226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0821    98.25 
 
 		 114 bp  210  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.900225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3342    98.25 
 
 		 114 bp  210  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0765    99.06 
 
 		 114 bp  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0100    96.36 
 
 		 1218 bp  186  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2681    96.36 
 
 		 1668 bp  186  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.594433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3598    96.36 
 
 		 1370 bp  186  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.25982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4800    96.36 
 
 		 860 bp  186  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4894    96.36 
 
 		 2105 bp  186  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0908  ShiE  97.62 
 
 		 186 bp  151  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0561  putative IS1 encoded protein  96.43 
 
 		 225 bp  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000545935  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0750  transposase  96.43 
 
 		 207 bp  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3014  putative IS1 encoded protein  96.43 
 
 		 198 bp  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>