31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1549 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1549  putative sucrose phosphorylase  100 
 
 		 141 aa  293  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  99.23 
 
 		 559 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  99.23 
 
 		 559 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  99.23 
 
 		 559 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  98.46 
 
 		 559 aa  265  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  98.46 
 
 		 559 aa  265  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  89.23 
 
 		 559 aa  245  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  44.62 
 
 		 565 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  29.93 
 
 		 568 aa  70.5  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  34.31 
 
 		 578 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  34.31 
 
 		 578 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  34.31 
 
 		 578 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  30.94 
 
 		 586 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  34.29 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  29.29 
 
 		 584 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  30.77 
 
 		 556 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  28.57 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  35.8 
 
 		 561 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  29.5 
 
 		 581 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  34.26 
 
 		 645 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  29.69 
 
 		 555 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  28.06 
 
 		 585 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  28.99 
 
 		 591 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  28.68 
 
 		 598 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  24.64 
 
 		 589 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  25.76 
 
 		 649 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  30.22 
 
 		 587 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  24.44 
 
 		 575 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  29.86 
 
 		 643 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 		 644 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  21.48 
 
 		 575 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>