33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0556 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0570  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00711929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0556  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.118531  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0174  RNA polymerase sigma factor sigW, putative  43.18 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0178785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0408  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.61 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0176  RNA polymerase factor sigma-70  23.67 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000382421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4922  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  21.89 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.294902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5011  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  21.89 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5304  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  21.89 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.81366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2041  RNA polymerase factor sigma-70  26.55 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000162862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2305  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.86 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00225526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0424  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  23.39 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.582386 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0441  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.85 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0094  RNA polymerase factor sigma-70  21.71 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000196498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1027  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.36 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0340  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.93 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1741  sigma-24 (FecI-like)  23.78 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0218052 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0885  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  20.36 
 
 		 191 aa  42  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1693  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  20.86 
 
 		 216 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.355338  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2812  RNA polymerase factor sigma-70  24.87 
 
 		 206 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0444  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.5 
 
 		 212 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0155755  normal  0.700123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1198  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  21.69 
 
 		 313 aa  41.6  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0679  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.85 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2728  RNA polymerase factor sigma-70  24.52 
 
 		 223 aa  41.2  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5003  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  19.9 
 
 		 209 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0409  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.58 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3321  RNA polymerase factor sigma-70  23.3 
 
 		 213 aa  41.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0088  RNA polymerase factor sigma-70  24.54 
 
 		 220 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000937894  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1559  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  30.97 
 
 		 246 aa  41.2  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1326  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.3 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000354416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0402  RNA polymerase factor sigma-70  24.85 
 
 		 217 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.38021e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4376  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.35 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0469  sigma-70 region 2  25.14 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4496  RNA polymerase sigma factor SigE  26.53 
 
 		 269 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11684  normal  0.283711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>