22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3930 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3930  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1197    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4230  hypothetical protein  53.94 
 
 		 600 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  51.58 
 
 		 595 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  51.58 
 
 		 595 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  51.58 
 
 		 595 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0804  hypothetical protein  44.63 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  38.98 
 
 		 602 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4143  hypothetical protein  40.46 
 
 		 594 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7365  hypothetical protein  27.53 
 
 		 599 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0167  hypothetical protein  25.95 
 
 		 629 aa  81.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2254  hypothetical protein  25.6 
 
 		 606 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.706828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  26.87 
 
 		 552 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5288  hypothetical protein  27.5 
 
 		 574 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4578  hypothetical protein  27.5 
 
 		 574 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4885  hypothetical protein  33.98 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.925702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  26.67 
 
 		 579 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2617  hypothetical protein  33.33 
 
 		 623 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6208  hypothetical protein  22.01 
 
 		 560 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0190  phage integrase family protein  22.29 
 
 		 698 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00182049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 586 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  28.8 
 
 		 538 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  21.76 
 
 		 330 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>