22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4230 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4230  hypothetical protein  100 
 
 
600 aa  1215    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3930  hypothetical protein  54.17 
 
 
595 aa  588  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  52.83 
 
 
595 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  52.83 
 
 
595 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  52.83 
 
 
595 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0804  hypothetical protein  45.49 
 
 
613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  39.4 
 
 
602 aa  332  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4143  hypothetical protein  39.73 
 
 
594 aa  327  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7365  hypothetical protein  26.01 
 
 
599 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0167  hypothetical protein  28.45 
 
 
629 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  27.27 
 
 
552 aa  81.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5288  hypothetical protein  25.21 
 
 
574 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4578  hypothetical protein  25.21 
 
 
574 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4885  hypothetical protein  31.21 
 
 
617 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.925702  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2254  hypothetical protein  32.35 
 
 
606 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.706828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2617  hypothetical protein  30.27 
 
 
623 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129951  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0190  phage integrase family protein  20.6 
 
 
698 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00182049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2814  hypothetical protein  33.66 
 
 
586 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5046  phage integrase family protein  22.76 
 
 
792 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  24.1 
 
 
330 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  22.89 
 
 
559 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  26.01 
 
 
538 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>