33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0804 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0804  hypothetical protein  100 
 
 
613 aa  1231    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  44.69 
 
 
595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  44.69 
 
 
595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  44.69 
 
 
595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  43.95 
 
 
602 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3930  hypothetical protein  44.63 
 
 
595 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4230  hypothetical protein  45.56 
 
 
600 aa  435  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4143  hypothetical protein  43.56 
 
 
594 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7365  hypothetical protein  25.83 
 
 
599 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5288  hypothetical protein  28.21 
 
 
574 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4578  hypothetical protein  28.21 
 
 
574 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0167  hypothetical protein  25.25 
 
 
629 aa  87.4  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  29.52 
 
 
552 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2254  hypothetical protein  23.79 
 
 
606 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.706828  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2617  hypothetical protein  28.89 
 
 
623 aa  63.9  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129951  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4885  hypothetical protein  29.32 
 
 
617 aa  61.6  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.925702  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  26.1 
 
 
579 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0190  phage integrase family protein  22.53 
 
 
698 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00182049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  25.45 
 
 
538 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2814  hypothetical protein  31.68 
 
 
586 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  22.73 
 
 
330 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  19.6 
 
 
545 aa  51.2  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  19.6 
 
 
545 aa  51.2  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  24.02 
 
 
559 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5046  phage integrase family protein  23.2 
 
 
792 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  27.83 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  27.83 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1211  hypothetical protein  21.94 
 
 
548 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  27.83 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  27.83 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  27.83 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  27.83 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  27.83 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>