24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4321 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  56.59 
 
 		 559 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1211  hypothetical protein  35.88 
 
 		 548 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  34.55 
 
 		 545 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  34.55 
 
 		 545 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  33.53 
 
 		 579 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  33.65 
 
 		 538 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  30.7 
 
 		 552 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6754  hypothetical protein  30.07 
 
 		 633 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5715  hypothetical protein  31.25 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6273  hypothetical protein  28.17 
 
 		 633 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751843  normal  0.444824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  24.37 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  24.37 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  24.37 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3930  hypothetical protein  21.76 
 
 		 595 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5046  phage integrase family protein  23.39 
 
 		 792 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7707  hypothetical protein  21.82 
 
 		 603 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26795  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7405  hypothetical protein  21.82 
 
 		 603 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7314  hypothetical protein  21.82 
 
 		 603 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3329  hypothetical protein  21.82 
 
 		 603 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1470  hypothetical protein  21.82 
 
 		 603 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0264078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0267  hypothetical protein  21.82 
 
 		 603 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4230  hypothetical protein  23.8 
 
 		 600 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6208  hypothetical protein  24.29 
 
 		 560 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>