22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0098 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  100 
 
 
538 aa  1118    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6273  hypothetical protein  30.1 
 
 
633 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751843  normal  0.444824 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6754  hypothetical protein  30.57 
 
 
633 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  33.12 
 
 
579 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  30.75 
 
 
545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  30.75 
 
 
545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1211  hypothetical protein  28.96 
 
 
548 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  28.57 
 
 
559 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  33.65 
 
 
330 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5715  hypothetical protein  34.14 
 
 
324 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386341  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  26.53 
 
 
552 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5719  hypothetical protein  29.96 
 
 
323 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623713  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  25.63 
 
 
595 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  25.63 
 
 
595 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  25.63 
 
 
595 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  24.82 
 
 
602 aa  50.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  23.17 
 
 
710 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  23.17 
 
 
710 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  23.17 
 
 
710 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3930  hypothetical protein  28.65 
 
 
595 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7365  hypothetical protein  26.91 
 
 
599 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4230  hypothetical protein  30.68 
 
 
600 aa  43.9  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>