17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6754 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6754  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1302    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6273  hypothetical protein  84.68 
 
 		 633 aa  1088    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751843  normal  0.444824 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5715  hypothetical protein  94.7 
 
 		 324 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5719  hypothetical protein  94.03 
 
 		 323 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  30.57 
 
 		 538 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  30.07 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  25.36 
 
 		 559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1211  hypothetical protein  23.82 
 
 		 548 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643556  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  26.44 
 
 		 579 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  23.55 
 
 		 545 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  23.55 
 
 		 545 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  22.94 
 
 		 552 aa  89.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4578  hypothetical protein  28.04 
 
 		 574 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5288  hypothetical protein  28.04 
 
 		 574 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  31.54 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  31.54 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  31.54 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>