15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2617 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2617  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1237    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2814  hypothetical protein  75 
 
 
586 aa  833    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4885  hypothetical protein  47.37 
 
 
617 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.925702  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2254  hypothetical protein  27.49 
 
 
606 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.706828  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0167  hypothetical protein  26.88 
 
 
629 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0804  hypothetical protein  28.89 
 
 
613 aa  64.3  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4578  hypothetical protein  24.35 
 
 
574 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5288  hypothetical protein  24.35 
 
 
574 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3930  hypothetical protein  33.33 
 
 
595 aa  56.6  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  35.53 
 
 
595 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  35.53 
 
 
595 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  35.53 
 
 
595 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4230  hypothetical protein  29.12 
 
 
600 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4143  hypothetical protein  33.8 
 
 
594 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  32.58 
 
 
602 aa  48.9  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>