26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4143 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4143  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1198    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  49.75 
 
 
602 aa  555  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0804  hypothetical protein  43.73 
 
 
613 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3930  hypothetical protein  40.46 
 
 
595 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  41.61 
 
 
595 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  41.61 
 
 
595 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  41.61 
 
 
595 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4230  hypothetical protein  39.76 
 
 
600 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7365  hypothetical protein  31.95 
 
 
599 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0167  hypothetical protein  26.64 
 
 
629 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  29.82 
 
 
552 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  26.57 
 
 
579 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5288  hypothetical protein  27.27 
 
 
574 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4578  hypothetical protein  27.27 
 
 
574 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2254  hypothetical protein  45.16 
 
 
606 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.706828  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  24.23 
 
 
559 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  27.62 
 
 
538 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  21.58 
 
 
545 aa  50.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  21.58 
 
 
545 aa  50.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0190  phage integrase family protein  23.67 
 
 
698 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00182049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2617  hypothetical protein  33.8 
 
 
623 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129951  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  24.71 
 
 
330 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1211  hypothetical protein  23.1 
 
 
548 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643556  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6208  hypothetical protein  19.84 
 
 
560 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2814  hypothetical protein  37.5 
 
 
586 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4885  hypothetical protein  27.55 
 
 
617 aa  43.5  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.925702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>