10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0190 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0190  phage integrase family protein  100 
 
 		 698 aa  1456    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00182049  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  25.45 
 
 		 552 aa  63.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6208  hypothetical protein  24.83 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  21.68 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  21.68 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  22.54 
 
 		 602 aa  53.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  20.38 
 
 		 559 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  21.47 
 
 		 579 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0804  hypothetical protein  22.53 
 
 		 613 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5046  phage integrase family protein  18.77 
 
 		 792 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>