35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4568 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4568  methyltransferase type 12  100 
 
 
327 aa  644    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1380  hypothetical protein  37.69 
 
 
329 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.160264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1791  hypothetical protein  37.69 
 
 
329 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0523505  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0221  hypothetical protein  37.69 
 
 
329 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0423  hypothetical protein  37.69 
 
 
329 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0341  hypothetical protein  37.69 
 
 
414 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.484139  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0956  hypothetical protein  37.96 
 
 
342 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4836  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  31.84 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  28.67 
 
 
237 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  31.93 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  31.88 
 
 
293 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  31.36 
 
 
336 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  27.81 
 
 
338 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  27.36 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  30.22 
 
 
348 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.4 
 
 
379 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
234 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
236 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  32.4 
 
 
379 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  34.12 
 
 
276 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  29.01 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  41.98 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  35.29 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  23.94 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.57 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48704  predicted protein  43.86 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  25.12 
 
 
360 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.77 
 
 
205 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  27.88 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  25.69 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61090  hypothetical protein  33.83 
 
 
374 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  23.58 
 
 
359 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>