25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0592 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4008  hypothetical protein  77.52 
 
 		 1216 aa  1957    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39070  hypothetical protein  57.68 
 
 		 1224 aa  1349    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3674  hypothetical protein  76.59 
 
 		 1224 aa  1938    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01694  hypothetical protein  48.02 
 
 		 1236 aa  1090    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3784  hypothetical protein  74.47 
 
 		 1224 aa  1883    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066759  hitchhiker  0.000104585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3857  hypothetical protein  77.32 
 
 		 1224 aa  1959    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0716  hypothetical protein  74.96 
 
 		 1224 aa  1863    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3885  hypothetical protein  76.18 
 
 		 1224 aa  1918    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00122982  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3731  hypothetical protein  77.08 
 
 		 1224 aa  1956    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0667  hypothetical protein  77.32 
 
 		 1223 aa  1962    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.628117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3118  hypothetical protein  74.55 
 
 		 1223 aa  1890    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105944  unclonable  0.0000130275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0594  hypothetical protein  77.16 
 
 		 1224 aa  1956    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0592  hypothetical protein  100 
 
 		 1226 aa  2484    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344073  hitchhiker  0.00185688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0638  hypothetical protein  77.41 
 
 		 1223 aa  1966    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000140616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0525  hypothetical protein  73.82 
 
 		 1223 aa  1853    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.531602  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3382  hypothetical protein  77.57 
 
 		 1223 aa  1963    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0638  hypothetical protein  77.49 
 
 		 1223 aa  1966    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2245  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1233 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2991  hypothetical protein  74.43 
 
 		 1229 aa  1887    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4086  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1265 aa  249  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2616  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1243 aa  136  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99853  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4986  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1234 aa  116  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000850423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1846  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 1267 aa  89.4  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.502823 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1383  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1311 aa  70.5  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.847962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4476  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1235 aa  46.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>