25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4476 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4476  hypothetical protein  100 
 
 		 1235 aa  2527    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4986  hypothetical protein  49.6 
 
 		 1234 aa  1174    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000850423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0716  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1224 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3885  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1224 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00122982  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3118  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1223 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105944  unclonable  0.0000130275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3784  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1224 aa  116  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066759  hitchhiker  0.000104585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2991  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1229 aa  108  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0525  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1223 aa  108  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.531602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2245  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1233 aa  105  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01694  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1236 aa  105  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3857  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1224 aa  105  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885539 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1846  SMC domain-containing protein  22.78 
 
 		 1267 aa  100  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.502823 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3674  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1224 aa  92.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0667  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1223 aa  91.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.628117  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3382  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1223 aa  90.9  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0638  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1223 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0638  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1223 aa  89.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000140616 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4086  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1265 aa  87.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0594  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1224 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3731  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1224 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4008  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1216 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2616  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1243 aa  82.4  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39070  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1224 aa  82.4  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327141  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1383  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1311 aa  63.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.847962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0592  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1226 aa  46.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344073  hitchhiker  0.00185688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>