25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4086 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_4086  hypothetical protein  100 
 
 
1265 aa  2611    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3118  hypothetical protein  23.7 
 
 
1223 aa  269  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105944  unclonable  0.0000130275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0638  hypothetical protein  23.52 
 
 
1223 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000140616 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4008  hypothetical protein  23.61 
 
 
1216 aa  261  7e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3382  hypothetical protein  23.61 
 
 
1223 aa  261  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01694  hypothetical protein  23.37 
 
 
1236 aa  260  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0638  hypothetical protein  23.61 
 
 
1223 aa  260  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000321455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3885  hypothetical protein  23.2 
 
 
1224 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00122982  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0667  hypothetical protein  23.49 
 
 
1223 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.628117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39070  hypothetical protein  23.71 
 
 
1224 aa  254  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3857  hypothetical protein  23.38 
 
 
1224 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0594  hypothetical protein  23.38 
 
 
1224 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3731  hypothetical protein  23.24 
 
 
1224 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3784  hypothetical protein  23.75 
 
 
1224 aa  252  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066759  hitchhiker  0.000104585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0592  hypothetical protein  23 
 
 
1226 aa  251  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344073  hitchhiker  0.00185688 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3674  hypothetical protein  22.99 
 
 
1224 aa  249  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.534146  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0525  hypothetical protein  23.15 
 
 
1223 aa  248  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.531602  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2991  hypothetical protein  23 
 
 
1229 aa  244  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0716  hypothetical protein  23.01 
 
 
1224 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2245  hypothetical protein  22.45 
 
 
1233 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1846  SMC domain-containing protein  21.84 
 
 
1267 aa  163  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.502823 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4986  hypothetical protein  22.64 
 
 
1234 aa  144  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000850423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2616  hypothetical protein  29.3 
 
 
1243 aa  99  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99853  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4476  hypothetical protein  23.85 
 
 
1235 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1383  hypothetical protein  28.34 
 
 
1311 aa  75.1  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.847962  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>