26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1383 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1383  hypothetical protein  100 
 
 		 1311 aa  2680    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.847962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0638  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1223 aa  128  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3382  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1223 aa  127  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0638  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1223 aa  125  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000140616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0667  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1223 aa  118  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.628117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4008  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1216 aa  118  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2991  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1229 aa  115  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3731  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1224 aa  113  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01694  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1236 aa  112  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0594  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1224 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3857  hypothetical protein  21.03 
 
 		 1224 aa  106  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3674  hypothetical protein  21.03 
 
 		 1224 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1243 aa  93.6  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99853  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1846  SMC domain-containing protein  36.97 
 
 		 1267 aa  91.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.502823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3118  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1223 aa  89.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105944  unclonable  0.0000130275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0716  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1224 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2245  hypothetical protein  40.68 
 
 		 1233 aa  85.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3885  hypothetical protein  21.31 
 
 		 1224 aa  81.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00122982  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4086  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1265 aa  75.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0592  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1226 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344073  hitchhiker  0.00185688 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4476  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1235 aa  63.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0525  hypothetical protein  20.18 
 
 		 1223 aa  61.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.531602  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4986  hypothetical protein  20.33 
 
 		 1234 aa  59.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000850423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3784  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1224 aa  50.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066759  hitchhiker  0.000104585 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0956  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1234 aa  45.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39070  hypothetical protein  18.87 
 
 		 1224 aa  45.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>