26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39070 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0638  hypothetical protein  56.99 
 
 
1223 aa  1410    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000140616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0716  hypothetical protein  56.29 
 
 
1224 aa  1399    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3885  hypothetical protein  57.61 
 
 
1224 aa  1415    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00122982  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3731  hypothetical protein  56.46 
 
 
1224 aa  1407    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0667  hypothetical protein  56.55 
 
 
1223 aa  1411    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.628117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3118  hypothetical protein  56.87 
 
 
1223 aa  1393    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105944  unclonable  0.0000130275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0594  hypothetical protein  56.55 
 
 
1224 aa  1407    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3857  hypothetical protein  56.79 
 
 
1224 aa  1414    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3784  hypothetical protein  56.79 
 
 
1224 aa  1400    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066759  hitchhiker  0.000104585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0592  hypothetical protein  57.68 
 
 
1226 aa  1375    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344073  hitchhiker  0.00185688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0525  hypothetical protein  55.88 
 
 
1223 aa  1354    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.531602  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3382  hypothetical protein  56.83 
 
 
1223 aa  1406    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0638  hypothetical protein  56.91 
 
 
1223 aa  1410    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000321455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2245  hypothetical protein  35 
 
 
1233 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2991  hypothetical protein  56.13 
 
 
1229 aa  1399    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01694  hypothetical protein  46.54 
 
 
1236 aa  1050    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3674  hypothetical protein  56.46 
 
 
1224 aa  1406    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.534146  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39070  hypothetical protein  100 
 
 
1224 aa  2431    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4008  hypothetical protein  56.98 
 
 
1216 aa  1398    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4086  hypothetical protein  23.42 
 
 
1265 aa  261  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2616  hypothetical protein  23.58 
 
 
1243 aa  205  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99853  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4476  hypothetical protein  21.64 
 
 
1235 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1846  SMC domain-containing protein  31.13 
 
 
1267 aa  111  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.502823 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0956  hypothetical protein  19.12 
 
 
1234 aa  67  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1383  hypothetical protein  18.99 
 
 
1311 aa  53.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.847962  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4986  hypothetical protein  24.49 
 
 
1234 aa  52.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000850423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>