25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4008 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4008  hypothetical protein  100 
 
 		 1216 aa  2479    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39070  hypothetical protein  56.83 
 
 		 1224 aa  1353    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3674  hypothetical protein  93.92 
 
 		 1224 aa  2338    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01694  hypothetical protein  47.55 
 
 		 1236 aa  1078    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3784  hypothetical protein  81.43 
 
 		 1224 aa  2048    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066759  hitchhiker  0.000104585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3857  hypothetical protein  94.74 
 
 		 1224 aa  2357    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0716  hypothetical protein  81.1 
 
 		 1224 aa  2025    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3885  hypothetical protein  82 
 
 		 1224 aa  2079    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00122982  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3731  hypothetical protein  95.15 
 
 		 1224 aa  2367    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0667  hypothetical protein  94.33 
 
 		 1223 aa  2354    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.628117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3118  hypothetical protein  80.92 
 
 		 1223 aa  2033    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105944  unclonable  0.0000130275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0594  hypothetical protein  94.91 
 
 		 1224 aa  2363    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0592  hypothetical protein  77.52 
 
 		 1226 aa  1927    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344073  hitchhiker  0.00185688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0638  hypothetical protein  98.36 
 
 		 1223 aa  2446    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000140616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0525  hypothetical protein  83.24 
 
 		 1223 aa  2065    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.531602  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3382  hypothetical protein  98.6 
 
 		 1223 aa  2448    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0638  hypothetical protein  98.68 
 
 		 1223 aa  2452    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2245  hypothetical protein  34.37 
 
 		 1233 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2991  hypothetical protein  82.06 
 
 		 1229 aa  2046    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4086  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1265 aa  252  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2616  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1243 aa  221  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99853  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1846  SMC domain-containing protein  22.89 
 
 		 1267 aa  132  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.502823 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1383  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1311 aa  118  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.847962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4986  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1234 aa  103  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000850423 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4476  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1235 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>